Development of sensitive mass spectrometric techniques in protein and peptide identification

2.50
Hdl Handle:
http://hdl.handle.net/10029/10093
Title:
Development of sensitive mass spectrometric techniques in protein and peptide identification
Authors:
Jong APJM de; Meiring HD; Barosso B; Hove GJ ten; Heeft E van der
Other Titles:
Ontwikkeling van gevoelige massa spectrometrische technieken voor de identificatie van eiwitten en peptiden
Abstract:
This report describes the development of micro- and nano-scale liquid chromatographic and capillary zone electrophoretic separation techniques, combined with tandem mass spectrometry, for the sensitive structure analysis of proteins and peptides. Mass spectrometry is emerging as the method of choice for the characterisation and identification of unknown proteins and peptides. Sequence information obtained from derived peptides, such as naturally processed antigenic peptides and proteolytic fragments is used to identify the underlying source protein using an online database search for protein and DNA databases. Typical sensitivities of current MS methods come to around the sub-pmol (10-12) level of protein on a routine basis. Ongoing refinements in the technology, particularly the development of nano-scale technologies, makes successful applications possible down to the femto (10-15) and attomole (10-18) levels. Here we report on the results this laboratory will have developments in this field over the past year.; Dit rapport beschrijft de ontwikkeling van micro en nano-scale vloeistofchromatografie en on-line preconcentrering capillaire electrophorese gecombineerd met tandem massaspectrometrie bij gevoelige structuuranalyse analyse van eiwitten en peptiden. Massaspectrometrie is een sterk opkomende techniek voor het verkrijgen van sekwentie-informatie van deze biologisch relevante producten. De verkregen sekwentie-informatie van afgeleide peptiden (proteosomale peptiden en proteolyse producten) worden gebruikt voor het identificeren van het bijbehorende broneiwit met behulp van eiwit en DNA databanken. De gevoeligheid van de huidige MS technologieen ligt rond een picomol (10-12) hoeveelheid eiwit. Recente verfijningen, in het bijzonder de ontwikkeling van nano-schaal technologien brengen toepassingen op het femto (10-15) tot attomole (10-18) niveau binnen het bereik van de techniek. Hier rapporteren wij over de resultaten van het R&D programma in het jaar 1998 op het gebied van de karakterisering van eiwitten en peptiden met behulp van massaspectrometrie.
Affiliation:
LOC
Publisher:
Rijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu RIVM
Issue Date:
30-Nov-1999
URI:
http://hdl.handle.net/10029/10093
Additional Links:
http://www.rivm.nl/bibliotheek/rapporten/518002001.html
Language:
en
Series/Report no.:
RIVM Rapport 518002001
Appears in Collections:
RIVM reports - old archive

Full metadata record

DC FieldValue Language
dc.contributor.authorJong APJM deen_US
dc.contributor.authorMeiring HDen_US
dc.contributor.authorBarosso Ben_US
dc.contributor.authorHove GJ tenen_US
dc.contributor.authorHeeft E van deren_US
dc.date.accessioned2007-03-09T16:26:19Z-
dc.date.available2007-03-09T16:26:19Z-
dc.date.issued1999-11-30en_US
dc.identifier518002001en_US
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/10029/10093-
dc.description.abstractThis report describes the development of micro- and nano-scale liquid chromatographic and capillary zone electrophoretic separation techniques, combined with tandem mass spectrometry, for the sensitive structure analysis of proteins and peptides. Mass spectrometry is emerging as the method of choice for the characterisation and identification of unknown proteins and peptides. Sequence information obtained from derived peptides, such as naturally processed antigenic peptides and proteolytic fragments is used to identify the underlying source protein using an online database search for protein and DNA databases. Typical sensitivities of current MS methods come to around the sub-pmol (10-12) level of protein on a routine basis. Ongoing refinements in the technology, particularly the development of nano-scale technologies, makes successful applications possible down to the femto (10-15) and attomole (10-18) levels. Here we report on the results this laboratory will have developments in this field over the past year.en
dc.description.abstractDit rapport beschrijft de ontwikkeling van micro en nano-scale vloeistofchromatografie en on-line preconcentrering capillaire electrophorese gecombineerd met tandem massaspectrometrie bij gevoelige structuuranalyse analyse van eiwitten en peptiden. Massaspectrometrie is een sterk opkomende techniek voor het verkrijgen van sekwentie-informatie van deze biologisch relevante producten. De verkregen sekwentie-informatie van afgeleide peptiden (proteosomale peptiden en proteolyse producten) worden gebruikt voor het identificeren van het bijbehorende broneiwit met behulp van eiwit en DNA databanken. De gevoeligheid van de huidige MS technologieen ligt rond een picomol (10-12) hoeveelheid eiwit. Recente verfijningen, in het bijzonder de ontwikkeling van nano-schaal technologien brengen toepassingen op het femto (10-15) tot attomole (10-18) niveau binnen het bereik van de techniek. Hier rapporteren wij over de resultaten van het R&D programma in het jaar 1998 op het gebied van de karakterisering van eiwitten en peptiden met behulp van massaspectrometrie.nl
dc.format.extent1215000 bytesen_US
dc.format.extent1243988 bytes-
dc.format.mimetypeapplication/pdf-
dc.language.isoenen_US
dc.publisherRijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu RIVMen_US
dc.relation.ispartofseriesRIVM Rapport 518002001en_US
dc.relation.urlhttp://www.rivm.nl/bibliotheek/rapporten/518002001.htmlen_US
dc.titleDevelopment of sensitive mass spectrometric techniques in protein and peptide identificationen_US
dc.title.alternativeOntwikkeling van gevoelige massa spectrometrische technieken voor de identificatie van eiwitten en peptidenen_US
dc.contributor.departmentLOCen_US
All Items in WARP are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.