Hoge resolutie typering van Coxiella burnetii : Definitieve versie

2.50
Hdl Handle:
http://hdl.handle.net/10029/255487
Title:
Hoge resolutie typering van Coxiella burnetii : Definitieve versie
Authors:
Janse I; Bossers A; Roest HJ; van Rotterdam B
Other Titles:
High Resolution Typing of Coxiella burnetii
Abstract:
Coxiella burnetii is een intracellulaire bacterie die Q-koorts veroorzaakt. De genoomsequenties van een aantal isolaten die verkregen werden tijdens de Nederlandse Q-koorts uitbraak werden opgehelderd. Deze genoomsequenties dienen als basis voor verbeterde typeringsmethodes die nauwkeurigere bronopsporing en epidemiologische studies mogelijk maken. Daarnaast zijn de sequenties uiterst waardevol voor allerhande overig onderzoek, zoals naar de samenhang tussen de Nederlandse uitbraken en veranderde virulentiekenmerken. Als resultaat van dit project zijn er nu 19 C. burnetii isolaten van de Nederlandse uitbraak in kweek. Deze isolaten zijn voornamelijk afkomstig van veterinaire bronnen, maar er zijn ook enkele stammen van humane en omgevingsbronnen verkregen. De genomen van 3 isolaten zijn grotendeels opgehelderd en enkele voorlopige analyses zijn erop uitgevoerd. De ruwe sequentiedata van nog 4 isolaten komen binnenkort beschikbaar. De isolaten en genoomsequenties spelen een essentiële rol spelen in meerdere vervolgprojecten van de deelnemende onderzoeksgroepen. De ervaring die opgedaan is met het opwerken en sequencen van de C. burnetii genomen is van grote waarde voor lopend en toekomstig onderzoek naar C. burnetii en andere intracellulaire micro-organismen.<br>

Coxiella burnetii is an intracellular bacterium which causes Q-fever. The genomes from a number of isolates obtained from the Dutch outbreak, were sequenced. These genome sequences form the basis for improved typing methods, enabling more accurate source finding and epidemiological studies. In addition, the genome sequences are highly valuable for other research, for instance of the relation between the Dutch outbreak and altered virulence properties. As a result of this project, 19 isolates from the Dutch outbreak have been cultivated. These isolates were primarily obtained from veterinary sources, but a few were acquired from human or environmental sources. The genomes of 3 isolates have been almost completely sequenced and some preliminary analyses were performed. Raw sequences from 4 additional isolates will be available soon. The bacterial isolates and genome sequences play important roles in several ongoing projects from the research partners. The experience that was acquired with harvesting and sequencing C. burnetii genomes is highly valuable for current and future research of C. burnetii and other intracellular pathogens.<br>
Affiliation:
LZO
Publisher:
Rijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu RIVM; CVI; Lelystad
Issue Date:
29-Nov-2011
Additional Links:
http://www.rivm.nl/bibliotheek/rapporten/330302001.html; http://www.rivm.nl/bibliotheek/rapporten/330302001.pdf
Type:
Briefrapport
Language:
nl
Series/Report no.:
RIVM rapport 330302001
Sponsors:
VWS
Appears in Collections:
RIVM official reports

Full metadata record

DC FieldValue Language
dc.contributor.authorJanse I-
dc.contributor.authorBossers A-
dc.contributor.authorRoest HJ-
dc.contributor.authorvan Rotterdam B-
dc.date.accessioned2014-01-17T13:41:20-
dc.date.issued2011-11-29-
dc.identifier330302001-
dc.description.abstractCoxiella burnetii is een intracellulaire bacterie die Q-koorts veroorzaakt. De genoomsequenties van een aantal isolaten die verkregen werden tijdens de Nederlandse Q-koorts uitbraak werden opgehelderd. Deze genoomsequenties dienen als basis voor verbeterde typeringsmethodes die nauwkeurigere bronopsporing en epidemiologische studies mogelijk maken. Daarnaast zijn de sequenties uiterst waardevol voor allerhande overig onderzoek, zoals naar de samenhang tussen de Nederlandse uitbraken en veranderde virulentiekenmerken. Als resultaat van dit project zijn er nu 19 C. burnetii isolaten van de Nederlandse uitbraak in kweek. Deze isolaten zijn voornamelijk afkomstig van veterinaire bronnen, maar er zijn ook enkele stammen van humane en omgevingsbronnen verkregen. De genomen van 3 isolaten zijn grotendeels opgehelderd en enkele voorlopige analyses zijn erop uitgevoerd. De ruwe sequentiedata van nog 4 isolaten komen binnenkort beschikbaar. De isolaten en genoomsequenties spelen een essentiële rol spelen in meerdere vervolgprojecten van de deelnemende onderzoeksgroepen. De ervaring die opgedaan is met het opwerken en sequencen van de C. burnetii genomen is van grote waarde voor lopend en toekomstig onderzoek naar C. burnetii en andere intracellulaire micro-organismen.<br>nl
dc.description.abstractCoxiella burnetii is an intracellular bacterium which causes Q-fever. The genomes from a number of isolates obtained from the Dutch outbreak, were sequenced. These genome sequences form the basis for improved typing methods, enabling more accurate source finding and epidemiological studies. In addition, the genome sequences are highly valuable for other research, for instance of the relation between the Dutch outbreak and altered virulence properties. As a result of this project, 19 isolates from the Dutch outbreak have been cultivated. These isolates were primarily obtained from veterinary sources, but a few were acquired from human or environmental sources. The genomes of 3 isolates have been almost completely sequenced and some preliminary analyses were performed. Raw sequences from 4 additional isolates will be available soon. The bacterial isolates and genome sequences play important roles in several ongoing projects from the research partners. The experience that was acquired with harvesting and sequencing C. burnetii genomes is highly valuable for current and future research of C. burnetii and other intracellular pathogens.<br>en
dc.description.sponsorshipVWS-
dc.formatapplication/pdf-
dc.format.extent40 p-
dc.format.extent559 kb-
dc.language.isonl-
dc.publisherRijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu RIVM-
dc.publisherCVI-
dc.publisherLelystad-
dc.relation.ispartofRIVM rapport 330302001-
dc.relation.ispartofseriesRIVM rapport 330302001-
dc.relation.urlhttp://www.rivm.nl/bibliotheek/rapporten/330302001.html-
dc.relation.urlhttp://www.rivm.nl/bibliotheek/rapporten/330302001.pdf-
dc.subjectZIEKTENnl
dc.subjectMICROBIOLOGIEnl
dc.subjectgenoom sequencingnl
dc.subjectCoxiella burnetiinl
dc.subjecttyperennl
dc.subjectkweeknl
dc.subjectQ-koortsnl
dc.subjectgenome sequencingen
dc.subjectCoxiella burnetiien
dc.subjecttypingen
dc.subjectcultivationen
dc.subjectQ-feveren
dc.titleHoge resolutie typering van Coxiella burnetii : Definitieve versienl
dc.title.alternativeHigh Resolution Typing of Coxiella burnetiien
dc.typeBriefrapport-
dc.contributor.departmentLZO-
dc.date.updated2014-01-17T12:43:51Z-
dc.contributor.divisioncib-
All Items in WARP are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.