V3-serotyping programme evaluated for HIV-1 variation in the Netherlands and Curacao
Citations
Altmetric:
Series / Report no.
Open Access
Type
Report
Language
en
Date
1995-01-31
Research Projects
Organizational Units
Journal Issue
Title
V3-serotyping programme evaluated for HIV-1
variation in the Netherlands and Curacao
Translated Title
V3-serotyperingsprogramma geevalueerd voor HIV-1
variatie in Nederland en Curacao
Published in
Abstract
Doel van het onderzoek was om inzicht te verkrijgen in
de antigene en genetische variatie van het in Nederland en Curacao
circulerende humane immunodeficientie virus type 1 (HIV-1). De genetische
variatie tussen HIV-1 isolaten is aanzienlijk. De genetische variatie doet
zich vooral voor op een vijftal gebieden van het deel van het virale genoom,
dat codeert voor het externe envelop eiwit gp120 van HIV-1. Van deze vijf
gebieden is het derde variabele domein (V3) gelegen tussen
aminozuur-positities 269 en 331 van gp120 het meest uitvoerig bestudeerd.
Van de Nederlandse serummonsters reageerde 54.8% specifiek tegen een van de
peptiden p108, p109 of p110, welke representatief zijn voor het genotype B.
Voor wat betreft de monsters afkomstig uit Curacao werd een vergelijkbaar
resultaat gevonden, met dit verschil dat ten opzichte van de Nederlandse
monsters een relatief hoge frequentie van serum reactiviteit tegen p110 werd
gevonden. Op grond van de serologische reactiviteit in het V3 gebied kan
worden geconcludeerd dat in de periode 1988 - 1990 in Nederland en Curacao
subtype B HIV-1 varianten het meest prevalent waren. De V3-loop
reactiviteit bleek vergelijkbaar met die gemeten in de Amsterdamse
cohortstudies onder homoseksuele mannen en druggebruikers. De resultaten
van de specifieke antistofreactiviteit werd in het algemeen bevestigd door
de resultaten van het V3 sequentie-onderzoek, maar subtiele
sequentieverschillen tussen de V3 loop reactiviteit en circulerend viraal V3
werden in een aantal gevallen aangetoond. Aanbevolen wordt in 1995 een
tweede survey uit te voeren, te meer daar inmiddels meer bekend is over
verschillende subtypen van HIV-1 en recent het zogeheten subtype O is
beschreven.
To obtain insight into the variation of the HIV-1 V3 neutralization domain of variants circulating in the Netherlands, 126 Dutch, 70 Curacao and 45 African serum samples from HIV-1 infected individuals were screened for antibody reactivity to a set of 16 to 17 mer synthetic peptides, representing the central part of the V3-loop of gp120 of HIV-1 variants circulating in the US, Europe and Africa. These peptides were used in an ELISA and antibody reactivity to the peptides was compared to the actual amino acid sequence of viral RNA circulating in a subset of the same serum samples. In conclusion, we found a relatively high genetic and antigenic homogeneity of the V3 gene of HIV infections in the Netherlands and Curacao during the years 1988-1990. Antibody reactivity to synthetic V3 peptides, as well as sequence analysis confirmed the prevalence of B subtype HIV-1 among the Dutch and Curacaon samples and the prevalence of A/D subtypes among the Tanzanian samples. Screening of HIV-1 positive serum samples for genetic typing by using a set of well defined synthetic V3 peptides appeared to be feasible. In combination with molecular analysis (V3 sequencing and/or hetroduplex mobility assay) of this method can be applied to obtain insight in changes in genetic and antigenic variation of HIV-1 in a population: changes within subtype B HIV-1 variants, as well as introduction of other (new) HIV-1 variants can this be surveyed. This is of importance to obtain insight in the (molecular) epidemiology of HIV-1 as well as with respect to the development and the eventual use of an HIV-1 vaccine.
To obtain insight into the variation of the HIV-1 V3 neutralization domain of variants circulating in the Netherlands, 126 Dutch, 70 Curacao and 45 African serum samples from HIV-1 infected individuals were screened for antibody reactivity to a set of 16 to 17 mer synthetic peptides, representing the central part of the V3-loop of gp120 of HIV-1 variants circulating in the US, Europe and Africa. These peptides were used in an ELISA and antibody reactivity to the peptides was compared to the actual amino acid sequence of viral RNA circulating in a subset of the same serum samples. In conclusion, we found a relatively high genetic and antigenic homogeneity of the V3 gene of HIV infections in the Netherlands and Curacao during the years 1988-1990. Antibody reactivity to synthetic V3 peptides, as well as sequence analysis confirmed the prevalence of B subtype HIV-1 among the Dutch and Curacaon samples and the prevalence of A/D subtypes among the Tanzanian samples. Screening of HIV-1 positive serum samples for genetic typing by using a set of well defined synthetic V3 peptides appeared to be feasible. In combination with molecular analysis (V3 sequencing and/or hetroduplex mobility assay) of this method can be applied to obtain insight in changes in genetic and antigenic variation of HIV-1 in a population: changes within subtype B HIV-1 variants, as well as introduction of other (new) HIV-1 variants can this be surveyed. This is of importance to obtain insight in the (molecular) epidemiology of HIV-1 as well as with respect to the development and the eventual use of an HIV-1 vaccine.
Description
Publisher
Sponsors
GHI